本馆定编14人，现有在编职工15人，返聘职工1人。馆领导班子为馆长1人、书记1人、副馆长1人，馆内设立办公室、业务指导科、档案管理科、声像技术科和信息技术科等科室。

    本馆馆藏档案分综合类、城市勘测类、城市规划基础资料类、城市规划类、城市建设管理类、市政及水利工程类、公用设施类、交通运输工程类、工业建筑类、民用建筑类、名胜古迹园林绿化类、环境保护类、地下管线类、县（镇）建设类、人防军事工程类、声像类共十六大类。档案来源于绍兴市城市规划区范围内（包括越城区、绍兴经济开发区、袍江新区、镜湖新区、生态产业园等）的各机关、团体、部队、学校、企事业等单位。

    近年来，绍兴市城市建设档案馆不断规范管理，加强收集和指导力度，接收了小舜江供水工程等重点建设项目和地下管线普查档案等，馆藏档案日益丰富，馆藏结构不断优化。

    绍兴市城市建设档案馆装有库房温湿度自动监控及防火防盗监视报警系统，并配置了工程扫描仪、微波消毒机等现代化设备，对馆藏档案进行科学管理，2003年绍兴市城建档案信息网站建成运行。目前，馆藏14余万卷档案全部实行计算机检索，部分重要档案进行了数字化扫描处理，馆藏档案的数字化工作已正式启动。2001年以来，承担了多项市级以上重点科研项目的开发建设任务，并通过鉴定和获奖，如：《绍兴古桥的技术与文化研究》获2003年绍兴市科技进步二等奖；《绍兴市地下管线信息管理系统》获2006年中国地理理信息系统优秀工程铜奖。

    绍兴市城市建设档案馆紧紧围绕服务城市建设与构建和谐社会的需要，积极主动地开展利用工作，充分开发城建档案信息资源，编研工作走在全国同行的前列。先后公开出版发行了《绍兴老屋》、《绍兴古桥》、《绍兴街巷》等具有地方特色的精品编研材料，并荣获浙江省档案优秀编研成果一等奖和绍兴市文化强市建设优秀文化作品。